Od března 2018 startuje EET i pro praktické lékaře, kterých je v České republice zhruba 5500.

Další povinné subjekty jichž se týká třetí vlna zavedení  EET  jsou kromě lékařů ostatní činnosti: právníci, veterináři, účetní, vyjma těch v poslední fázi, například svobodná povolání, doprava, zemědělství. Třetí vlna elektronické evidence tržeb startuje přesně 1. března 2018.

Lékaři kromě EET budou mít ještě další povinnost, a to vydávání tzv. eReceptů.

Především starší lékaři, z nichž mnozí nemají dodnes ani počítač, projevili nevoli s eRecepty a EET.  
Někteří z nich hrozí, že své ordinace raději zruší než by se přizpůsobili novým pravidlům.
Jde především o lékaře z méně atraktivních regionů, kde bude obtížné za ně najít náhradu.
Z tohoto důvodu ( zavedení EET a eRecepty ) se chystá zavření téměř stovky ordinací praktických lékařů, kterých už teď začíná být nedostatek.

Česká lékařská komora se dokonce vyjádřila, že by v této oblasti mohlo dojít až k personální krizi.Uzavření ordinací by se týkalo především méně atraktivních lokalit a dotčení lékaři by zřejmě zrušili i detašovaná pracoviště v menších obcích, kam za pacienty dojíždějí.

Elektronické recepty zavedl v Česku zákon v roce 2007.
Od roku 2018 bude pro lékaře předepisování eReceptů povinné.

Ministerstvo zdravotnictví počítá se zmírněním povinnosti v situacích, kdy bude výpadek elektřiny či internetu, nebo lékař nebude mít z terénu připojení.
Pacient kromě papírového receptu bude moci dostat i e-mail nebo SMS.